Но это не страшнее оригинальных вариантов.
Действительно ли образец теста на COVID из Франции был идентифицирован как «Дельтакрон»?. Депозитные фото
В середине февраля команда Института Пастера во Франции загрузила геном SARS-CoV-2 со странным генеалогическим древом в глобальную эпидемиологическую базу данных. Как объяснил один ученый на форуме, используемом для выявления новых вариантов, вирус, который заразил пожилого мужчину на севере Франции, по-видимому, делил свое «тело» с Дельтой, но заимствовал генетическую информацию для большинства своих шиповидных белков у Омикрона.. Основываясь на стандартном соглашении об именах, новый тип COVID, если он останется, скорее всего, будет называться «XD. Публика называла его «Дельтакрон».
Месяц спустя вторая команда опубликовала свои собственные предварительные данные о том, что три подобных случая были зарегистрированы в США в разгар всплеска Омикрона, в период с ноября 2021 года по февраль 2022 года.
SARS-CoV-2 раньше производил гибриды, в основном с альфа-вариантом. Но ни один из них не привел к массовым вспышкам, а вместо этого исчез перед лицом новых штаммов.
Организмы обмениваются генетическим кодом с удивительной регулярностью - вирусы гриппа, например, имеют модульную структуру, которая позволяет им обмениваться целыми сегментами друг с другом. Если человек подхватывает два штамма COVID одновременно (редко, но возможно, когда заболевают миллионы), патогены могут проходить через процесс, называемый «рекомбинацией», когда они размножаются, оставляя части себя внутри другого.
В большинстве случаев такой обмен в «Чумовой пятнице» убивает вирус. Но время от времени рекомбинант имеет достаточно неповрежденных фрагментов, чтобы выжить и продолжить распространение, что, по-видимому, произошло во французском случае «XD», который сейчас попал в заголовки..
Почему вы, вероятно, уже слышали о «Дельтакроне»
Ранее в этом году Bloomberg и другие новостные агентства трубили о возможности появления на Кипре штамма «Deltacron». Эти заголовки были опровергнуты, даже если гибридные варианты COVID оставались возможными.
Репортаж основан на интервью, показанном местным телеканалом. Леондиос Кострикис, микробиолог из Университета Кипра, сказал, что его лаборатория выявила случаи дельта-варианта с несколькими случайными мутациями, похожими на те, что наблюдались на Омикроне..
Другие ученые, в том числе один из Всемирной организации здравоохранения, поспешили сказать, что, хотя рекомбинация возможна, это, похоже, не так. Проблема заключалась в генетических данных, которые, по мнению многих сторонних наблюдателей, свидетельствовали о перекрестном загрязнении образцов. Другими словами, кипрская лаборатория могла секвенировать отдельные вирусы Омикрон и Дельта одновременно, а не их гибрид.
В январском интервью Nature Кострикис сказал, что его слова были неверно истолкованы, и что он не думает, что вирусы были настоящим гибридом. Он объяснил, что дельта- и омикрон-подобные черты в секвенированном им варианте могли быть результатом конвергентной эволюции - точно так же, как у летучих мышей и птиц есть крылья. Он также утверждал, что его образцы не были заражены, и изъял их из базы данных с открытым исходным кодом, ожидая, пока другие эксперты подтвердят его выводы.
Но было и другое более простое объяснение, чем перекрестное заражение: иногда вирусы просто имеют несколько перекрывающихся мутаций. Последовательности с признаками нескольких вариантов «все время загружаются», - сказал в то время журналу Nature Томас Пикок, изучающий эволюцию вирусов в Имперском колледже Лондона. «Но, как правило, людям не нужно разоблачать их, потому что о них не так много международной прессы».
Это опять поддельный «Дельтакрон»?
Ученые гораздо больше уверены, что новый штамм из Франции - настоящий рекомбинант. Данные генетического секвенирования чище, и команда Института Пастера сообщает, что они культивировали вирус в лаборатории, демонстрируя, что он не является продуктом перекрестного заражения.
Но то, что новый вариант сочетает в себе генетический материал двух штаммов, не означает, что он будет сочетать их худшие черты в реальной жизни. Дельта и Омикрон - очень разные вирусы: они проникают в клетки человека разными путями и, по-видимому, разработали разные стратегии уклонения от иммунной системы человека. Совершенно не очевидно, что смешивание и сопоставление двух независимо развившихся наборов мутаций улучшит вирус, а не просто создаст хаотичную мешанину. Omicron удивил вирусологов отчасти тем, что использовал странный набор приспособлений, чтобы «разблокировать» ключевой рецептор на клетках человека для проникновения в них. Каждая мутация по отдельности могла ухудшить работу вируса, но вместе они оказались чрезвычайно эффективными.
С тех пор как в прошлом месяце был диагностирован случай «Дельтакрона», исследователи выявили примерно 30 подобных случаев во Франции, Нидерландах и Дании. (Однако неясно, все ли они произошли от одной и той же инфекции.) Этого достаточно, чтобы предположить, что рекомбинант способен распространяться. Тем не менее, учитывая, что в настоящее время в Европе наблюдается новый всплеск случаев заболевания COVID, потребуется гораздо более 30 случаев «Дельтакрона», чтобы продемонстрировать, что гибрид представляет большую угрозу, чем вирус, который уже находится перед нами.