Google обеспечивает хорошие результаты поиска, поскольку учитывает не только веб-страницы, но и гиперссылки между ними. Исследователи теперь использовали аналогичную стратегию в исследованиях рака. Они использовали модифицированную версию алгоритма Google PageRank для изучения 20 000 белков на предмет их влияния на прогрессирование рака поджелудочной железы. Как сообщают ученые в журнале «PLoS Computational Biology», они обнаружили семь белков, которые могут помочь определить агрессивность диагностированной опухоли на основе опухолевой ткани. Основываясь на этой информации, врач, лечащий пациента, может затем решить, принесет ли химиотерапия пользу пациенту.
В своем исследовании ученые из Технического университета Дрездена искали так называемые биомаркеры - молекулы, которые вырабатываются опухолью и которые могут указывать на дальнейшее течение или рецидив рака. Несмотря на интенсивные исследования во всем мире, до сих пор было обнаружено лишь несколько надежных биомаркеров. Серьезной проблемой является большое количество возможных молекул и тот факт, что маркеры, обнаруженные в исследованиях, часто не воспроизводятся в других исследованиях.
В текущем исследовании исследователи решили эту проблему, используя стратегию, скопированную из поисковой системы Google: белки в клетке часто вступают в партнерские отношения, чтобы вместе выполнять задачу. Эта социальная сеть белков, так сказать, «белковый Facebook», оказала решающую помощь в поиске биомаркеров. «После того, как мы включили в наш анализ сетевую информацию о белках, наши результаты значительно улучшились, и их можно было воспроизвести», - объясняет Кристоф Винтер из BIOTEC в Техническом университете Дрездена. Ученые из Университета Северной Каролины ранее обнаружили шесть белков, указывающих на агрессивность рака поджелудочной железы. Один из этих белков также был обнаружен в исследовании в Дрездене.
До применения еще далеко
Хотя новые биомаркеры представляют собой улучшение по сравнению с используемыми в настоящее время методами, предстоит пройти еще долгий путь, прежде чем их можно будет использовать в клинической практике. Более крупное исследование должно сначала показать, насколько хорошо маркеры на самом деле отфильтровывают белки, указывающие на дальнейшее течение рака. «Было бы очень важным шагом использовать агрессивные методы лечения, такие как химиотерапия, только у пациентов, которые, скорее всего, получат от них пользу. Здесь могут помочь такие прогностические тесты», - говорит Роберт Грюцманн, старший врач и научный сотрудник клиники висцеральной, торакальной и сосудистой хирургии UKD.
По данным German Cancer Aid, в настоящее время в Германии ежегодно диагностируется 14 случаев.200 человек с новым диагнозом рака поджелудочной железы. При раке поджелудочной железы, даже в большей степени, чем при многих других видах рака, шансы на выздоровление и выживание тем выше, чем раньше опухоль обнаружена и вылечена. Поэтому также важным вопросом является то, могут ли маркеры помочь в разработке лекарств, подавляющих рост рака, и если да, то каким образом. В сотрудничестве с дрезденской компанией «RESprotect», которая специализируется на разработке лекарств от рака поджелудочной железы, ученые теперь будут работать над внедрением своих открытий в улучшенную терапию в долгосрочной перспективе.