Наиболее распространенный штамм ВИЧ мог распространиться гораздо раньше, чем считалось ранее. Новое исследование, опубликованное в журнале Nature, показывает, что СПИД появился в первых городских центрах Западной Африки между 1884 и 1924 годами.
Международная группа ученых под руководством Майкла Вороби из Аризонского университета в Тусоне исследовала распространение и происхождение штамма ВИЧ-1 группы М вируса СПИДа. Для этого проекта, финансируемого Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний США (NIAID), исследователи проанализировали образцы тканей на четырех континентах и провели поиск генетических вариантов вируса ВИЧ.
Самый старый вирус, обнаруженный в образце ткани из Киншасы
В образце лимфатического узла женщины из Киншасы, сохраненном воском, ученые обнаружили 48-летние фрагменты гена штамма M группы ВИЧ-1. Они сравнили это с самой старой из известных генетических последовательностей ВИЧ, полученной из образца крови, взятого в 1959 году у человека, который также умер в Киншасе. Сравнение конкретных областей генов обоих образцов позволяет предположить, что им обоим потребовалось не менее 40 лет эволюции, чтобы эволюционировать от общего предка. Этот результат относит первые случаи заражения людей этим вирусом HI как минимум к 1900 году и, таким образом, на целых 30 лет раньше, чем предполагалось ранее.
Реконструировано генеалогическое древо штамма вируса
Чтобы подтвердить это открытие, исследователи использовали последовательности генов ВИЧ-1 из этого и десятков других образцов тканей и построили несколько возможных генеалогических деревьев для этого штамма вируса. Затем из числа генетических различий, вызванных мутациями, они определили период времени, который должен был потребоваться для каждой из этих мутаций. Затем они рассчитали время, когда мог появиться первый предок этого штамма вируса. Для всех генеалогических деревьев наиболее вероятным периодом был рубеж 19-20 веков.
Период с 1884 по 1924 год, когда, возможно, появился штамм вируса ВИЧ-1 группы М, совпадает с развитием первых крупных центров в западноафриканском регионе, куда был впервые занесен вирус ВИЧ, вызвавший эпидемию.. По мнению исследователей, это говорит о том, что урбанизация и связанное с ней рискованное поведение проложили путь к пандемии СПИДа.