Бактерии на нашем теле более разнообразны, чем предполагалось
Человеческая кожа является домом для неожиданно широкого спектра микроорганизмов, сообщают исследователи после изучения геномов микробов, которые там живут. Успех их изучения прежде всего основан на новых и очень точных методах генной инженерии. В предыдущих анализах бактерии можно было обнаружить только с помощью культивируемых культур.
Джулия Сегре из Национального исследовательского института генома человека и ее коллеги взяли образцы с 20 участков кожи у десяти здоровых людей. Из каждого исследователи извлекли ДНК и секвенировали ген 16s рРНК, тип гена, характерный для бактерий. Они определили более 112 000 последовательностей генов, которые затем классифицировали и сравнили. Анализ выявил 205 различных родов и 19 различных штаммов бактерий, причем большинство микроорганизмов принадлежит к Actinobacteria (51,8%), Firmicutes (24,4%), Proteobacteria (16,5%) и Bacteroidetes (6,3%).
Сегре и ее команда также показали, что бактериальное разнообразие - по крайней мере, у здоровых людей - зависит, в частности, от части тела. Сухие участки кожи, такие как ладони, и влажные участки, такие как подмышки, поэтому имеют больший спектр микробов, чем жирные участки, которые можно найти, например, между бровями. Они обнаружили наибольшее разнообразие на предплечье и наименьшее за ухом.
Их работа послужит важной основой для новых подходов к лечению и защите от кожных заболеваний, сказал Сегре. Результаты и данные исследования находятся в свободном доступе для ученых всего мира. Вместе с другими команда надеется как можно быстрее расшифровать сложные генетические и экологические факторы, играющие роль в развитии экземы, акне и многих других кожных воспалений.
В 2007 году исследовательская группа под руководством Чжана Гао из Нью-Йоркского университета проанализировала микроорганизмы на предплечьях шести испытуемых и обнаружила там в общей сложности 182 различных вида. В 2008 году Ной Фиерер из Университета Колорадо в Боулдере и его коллеги обнаружили в среднем 150 видов бактерий на ладонях 51 студента. Обе команды также работали с методами генной инженерии.